A estrutura organizacional do CIBRIUS é composta pela Diretoria Executiva e pelos Conselhos Deliberativo e Fiscal que são diretamente responsáveis pela gestão do patrimônio do Plano de Benefícios CONAB, administrado por esta Entidade, além de outras atribuições pertinentes a cada cargo. Com o fim da Intervenção Federal na Entidade, ocorrido no dia 30 de novembro de 2007, estabeleceu-se novamente a estrutura dos Órgãos Estatutários, estando a Diretoria Executiva assim constituída:
Diretor Superintendente - FABRÍCIO PEREIRA GARCIA
Diretor Financeiro - JOSÉ CARLOS ALVES GRANGEIRO
Diretor de Seguridade - RACHID MAMED FILHO